Exklusiv ließ der 48-Jährige gegenüber dem US-amerikanischen Magazin „People“ durch seinen Anwalt Stanton „Larry“ Stein erklären, dass er sich freiwillig zu diesem Schritt entschlossen habe. Außerdem sprach der Hollywood-Schauspieler folgende Bitte aus: „Ich bitte um Respekt und eine Privatsphäre für meine Frau und meine Kinder, während wir diese Situation als Familie angehen.“ Duchovny ist seit 1997 mit der sechs Jahre jüngeren Schauspielkollegin Téa Leoni verheiratet. Das Paar hat zwei Kinder: Tochter Madelaine West ist neun Jahre alt und Sohn Kyd sechs.
Die Macher von „People“ haben sich einmal frühere Interviews des „Akte X“-Stars angesehen, in denen er mitunter recht offen über sein Sexualleben berichtet hat. Zu Beginn dieses Jahres beispielsweise wurde er im Magazin „Best Life“ so zitiert: „Vor Téa hielt mein intensives sexuelles Interesse vielleicht zwei Jahre an.“ Aber schon in den neunziger Jahren wurde er mit Gerüchten, er sei sexsüchtig, konfrontiert: „Wenn du Single bist und unter öffentlicher Beobachtung stehst und ein paar Dates hast, bist du ein Sexsüchtiger“, so Duchovny gegenüber „Cosmopolitan im Jahr 1997. Ein Jahr später war im „Playboy“ zu lesen, dass er nichts gegen Hotelpornografie hat und ein Fan von Pornostars der achtziger Jahre ist.